Je nach viewport (media query) unterschiedliche templates laden

Ich würde das vermutlich mit wp_is_mobile() lösen. Erläuterungen dazu findest du hier.

Um längere Code-Abschnitte zu teilen sind Dienste wie Pastebin.com oder GitHub besser geeignet.

Davon abgesehen … was hast du denn dauernd mit get_template() vor? 🙂
Hast du dir dazu mal die Beschreibung im Codex durchgelesen? 😉

Retrieves the directory name of the current theme, without the trailing slash.

Es ist auch nicht so, dass du ein anderes Template lädst. Statt dessen führst du, wenn Mobilgeräte erkannt wurden, einen anderen PHP-Code durch. Da das dynamisch passiert (d.h. es wir fallweise jedesmal neu entschieden, welcher Code ausgeführt wird) funktioniert, wie Monika schon völlig richtige monierte, das Cachen der Seite nicht. Nun aber zum Code:

Nehmen wir an, dein Slider-Plugin verfügt über Shortcodes. Um auf Mobilgeräten ein hübsches (Stand-)Bild auszugeben, auf anderen Geräten aber den Slider könnte der Code so aussehen:

if( wp_is_mobile() ) {
  echo '<img src="' . get_stylesheet_directory_uri() . '/images/standbild.jpg" alt="Standbild">';
} else {
  echo do_shortcode( '[awesomeslider id=42]' ); // siehe Anmerkung *
}

(*Noch besser wäre es, direkt die Funktion einzufügen, die durch den Shortcode aufgerufen wird. Dann muss der Shortcode nicht erst umgewandelt werden.)

if( wp_is_mobile() ) {
  echo '<img src="' . get_stylesheet_directory_uri() . '/images/standbild.jpg" alt="Standbild">';
} else { ?>

<!-- BEGINN BANNERROTATION -->
<script type="text/javascript">
<!--
var z= 3;
Banner = new Array(z);

Banner[0] = '<IMG SRC="http://localhost:8888/wp-content/.../xy.jpg" ALT="" WIDTH= HEIGHT= BORDER=0>';
Banner[1] = '<IMG SRC="http://localhost:8888/wp-content/.../xyz.jpg" ALT="" WIDTH= HEIGHT= BORDER=0>';

var jetzt=new Date();
var z=(jetzt.getSeconds())%2;
document.write(Banner[z]);
//-->
</script>
<!-- ENDE BANNERROTATION -->

<?php } ?>

Mit eigenen Worten und anfängerhaft beschrieben, wurde das Banner-script also aus der php-else-anweisung herausgenommen, es erscheint sozusagen separat als Text und kann ausgeführt werden.

Nein, ganz im Gegenteil. Der HTML-Code wird nur ausgeführt, wenn das if-Statement false ausgibt. Die Unterbrechung des PHP-Codes dient nur der besseren Lesbarkeit des HTML/JavaScript. Das kann aber auch alles per echo ausgegeben werden. Ein hübsches PHP-Tutorial auf Deutsch findest du z.B. hier.

Aber ich will ohnehin mit so wenig plugins arbeiten wie möglich, insofern ist das für mich ok.

Frag dich mal, warum du mit so wenig Plugins wie möglich arbeiten möchtest. Solltest du dabei zufällig auf den Gedanken kommen, damit die Performance zu verbessern – genau dafür sind Cache-Plugins gemacht.

Grundsätzlich stimmt die Aussage, dass sich die Performance mit jedem Plugin, dass geladen werden muss, verschlechtert. Allerdings kommt es auch darauf an, ob Plugins sich im Frontend oder Backend einbringen, wieviel Speicher sie benötigen, wieviel Abfragen sie ausführen, etc.

Cache-Plugin sollen aber das Ergebnis zwischenspeichern und damit genau das, was zu Performanceeinbußen führt (Aufruf und Ausführung der einzelnen Plugins) umgehen. Deshalb wäre es vermutlich an der falschen Stelle gespart, auf ein Cache-Plugin zu verzichten.