Wurde in Version 5.6.1 gefixt und ist damit nun tatsächlich gelöst.
Ok, das ist es. Danke für den Hinweis.
Die Fehlermeldung ist hartkodiert in public function test_wp_version_check_attached()
und diese Funktion prüft nur nach has_filter( 'wp_version_check', 'wp_version_check' )
Also ist zusätzlich zum eigentlichen Fehler auch die Fehlermeldung ausgesprochen unglücklich.